For å stille korrekt diagnose ved en mistenkt bakteriell infeksjon, tas en prøve med en vattpinne eller fra en liten mengde sekret eller væske (f eks urin). Prøven sendes til et laboratorium med kompetanse innen bakteriologi.
Avhengig av hva veterinæren ønsker undersøkt, dyrkes prøven på ulike kulturmedier, i ulike temperaturer og i ulike gassmiljøer. Av og til gjør laboratoriet også et såkalt direkteutstryk av prøven og analyserer det i mikroskop for å kunne gi et foreløpig svar.
Det tar flere dager å få et endelig svar fra en bakteriekultur. Bakteriene må vokse fram på dyrkningsmediene innen de kan arts- og resistensbestemmes. Ved en såkalt resistensbestemmelse undersøkes bakterieisolatets følsomhet for ulike antibiotika. Dette er et veldig viktig steg for å kunne behandle hunden eller katten med rett type av antibiotika. All antibiotika-bruk bør baseres på resultatet av en bakterieprøve med resistensbestemmelse.